Si realmente quieres que .nomedia haga su trabajo, sigue estos 3 pasos:
• agrega un archivo .nomedia a las carpetas que elijas
• elimina la caché / datos de la aplicación de tu galería de fotos usando el administrador de aplicaciones de tu dispositivo
• descarga/instala una aplicación gratuita de escaneo de medios desde el mercado (hay varias) e invócala... ¡este último paso reconstruirá la caché / datos de la galería de fotos... ¡CORRECTAMENTE esta vez!
Además, ni siquiera necesitas un dispositivo rooteado para esto: en el primer paso puedes usar cualquier administrador de archivos, incluso el básico que viene de serie con los dispositivos Android, en el segundo paso puedes usar el propio administrador de aplicaciones de tu dispositivo como se mencionó, y en el tercer paso hay aplicaciones de escaneo de medios tanto para dispositivos con y sin root, la diferencia está solo en algunas opciones adicionales, pero invocar el servicio de escaneo de medios de Android es solo una línea de código, no se necesita root.