Root:
Puedes instalar Titanium Backup para desinstalar aplicaciones no deseadas fácilmente.

Sin Root:
Encontré un artículo interesante que te ayuda a crear un script para eliminar ciertos archivos de APK de stock.
Échale un vistazo aquí.

1. Descarga el script BloatKill flashable en zip. No lo extraigas: bloatkill.zip.
2. Descarga e instala un programa de gestión de zip en tu ordenador, como WinRAR o PowerArchiver.
3. Haz doble clic en bloatkill.zip para abrir el zip
4. Ahora ve a META-INF\com\google\android\
5. Haz clic derecho en el archivo updater-script y extrae el archivo al escritorio. También puedes extraer este archivo arrastrándolo al escritorio.

6. Abre el archivo con un programa adecuado como NotePad++ o Adobe Dreamweaver. El archivo de script abierto debería verse así:

   ui_print("Removedor de aplicaciones de stock no deseadas.");

   ui_print(" "); ui_print("Montaje de particiones");

   Desmontaje correcto para evitar problemas

   run_program("/sbin/busybox", "umount", "/system"); run_program("/sbin/busybox", "umount", "/cache"); run_program("/sbin/busybox", "umount", "/data");

   Luego montar

   run_program("/sbin/busybox", "mount", "/system"); run_program("/sbin/busybox", "mount", "/cache"); run_program("/sbin/busybox", "mount", "/data");

   ui_print(" "); ui_print("Removedor de aplicaciones de stock no deseadas"); delete("/system/app/StockApp.apk");

   ui_print(" "); ui_print("Desmontando particiones"); run_program("/sbin/busybox", "umount", "/system"); run_program("/sbin/busybox", "umount", "/cache"); run_program("/sbin/busybox", "umount", "/data");

   ui_print(" "); ui_print("Finalizado");

La línea delete("/system/app/StockApp.apk"); siendo la aplicación que deseas eliminar.

1. Cuando la edición haya terminado, guarda los cambios y sal de NotePad++ o del editor que estés usando.
2. Ahora arrastra el archivo updater-script de vuelta a su lugar: META-INF\com\google\android\ en la carpeta bloatkill.zip
3. Ahora copia el archivo bloatkill.zip a la root/directorio principal de la tarjeta SD de tu teléfono (/sdcard/)
4. Abre Configuración del teléfono y habilita el Modo de depuración de USB desde Opciones de Desarrollador.
5. Apaga tu dispositivo y arráncalo en Modo de Recuperación. El método implica una combinación especial de teclas de hardware que se presionan simultáneamente y que varían de un dispositivo a otro.
6. En el modo de recuperación, utiliza las teclas de volumen para desplazarte/seleccionar y la tecla de encendido para seleccionar una opción.
7. Desplázate a una opción llamada aplicar zip desde tarjeta sd y selecciona el archivo bloatkill.zip.
8. Confirma tu elección seleccionando sí.
9. Por último, selecciona reiniciar sistema ahora.

No puedes desinstalarlos si no estás con permisos de administrador, pero puedes desactivar algunos de ellos. ¡No todos!
Ve a Ajustes --> Administrador de aplicaciones --> selecciona la aplicación que deseas desactivar --> y desactívala