La aplicación Stock Google Music no escanea el subdirectorio en Android 4.2.1

¿Es un error de Jelly Bean 4.2.1 que los subdirectorios dentro del directorio de música no se analizan en busca de archivos de música?

ACTUALIZACIÓN: Acabo de comprobar que la copia mediante cp o utilizando Nautilus en Ubuntu o Windows Explorer funciona bien. El reproductor los escanea inmediatamente. Pero si utilizo rsync ¡no lo son! Esto es muy extraño. También he comprobado los permisos de los archivos y son los mismos en ambos casos.

Estoy intentando sincronizar la colección de música de mi ordenador de sobremesa con mi Nexus 4. En mi escritorio mi música está organizada de la siguiente manera.

    Artist1/
        Artist1/Art1_Track1.mp3
        Artist1/Art1_Track.mp3
    Artist2/
        Artist2/Art2_Track1.mp3
        Artist2/Art2_Track2.mp3
    ...

Cuando copio la misma estructura de directorios en el directorio de música, el reproductor de música de stock no explora la música en los subdirectorios. Sin embargo, funciona bien para los archivos en el directorio base de Música.

Para que sepas, uso rsync para sincronizar la colección de música con el directorio Music. Estoy usando Android 4.2.1 Jelly Bean en el LG Nexus 4. El dispositivo está montado usando go-mtpfs en una instalación de Ubuntu.

Actualización: Un resumen de los comentarios (por Izzy)

• el problema sólo existe cuando los archivos se transfieren utilizando rsync . Mientras que rsync está en curso, los archivos obtienen una extensión de nombre de archivo temporal como, por ejemplo .test.mp3.xdGHsk -- pero se renombran correctamente a .mp3 una vez finalizada la transferencia (comportamiento normal para rsync )
• no hay .nomedia archivos en los directorios afectados
• Rescan Media se utiliza para forzar al escáner de medios a actualizar la biblioteca después de rsync completó su trabajo

Actualización: Más resumen de los comentarios y corrección (por Srinath)

• El modo de conexión USB es MTP, en el PC Linux el dispositivo se monta utilizando go-mtpfs (Implementación del sistema de archivos MTP en lenguaje Go)
• Los archivos transferidos mediante rsync pueden verse y reproducirse con una aplicación de navegación de archivos como ES File Explorer