Utilice BoxCryptor . Tiene aplicaciones complementarias para Windows, Mac, iPhone e iOS. Puedes guardar tus archivos encriptados en la nube (Dropbox, Google Drive o Microsoft SkyDrive) y acceder a ellos en cualquier plataforma.
Yo también lo uso regularmente para los archivos sin conexión (lo que buscas). Mantengo el contenedor encriptado de BoxCryptor en mi Dropbox y uso la sincronización bidireccional de FolderSync para llevar todos los archivos fuera de línea en la tarjeta SD. Luego, uso BoxCryptor para descifrar esos archivos localmente cuando quiero.
Si no quieres usar la nube, no la uses. Elija la tarjeta SD en la aplicación BoxCryptor. Después de insertar la tarjeta SD en el PC o Mac, uno necesita las aplicaciones BoxCryptor de Windows, Mac (los archivos encriptados son compatibles con EncFS-Linux
también) y la contraseña para leer esos archivos y carpetas (los nombres de los archivos y las carpetas también están cifrados).