Android almacena sus fuentes en /system/fonts/ utilizando el formato TTF (TrueType). Si tienes un programa que pueda editar archivos TTF (por ejemplo, FontForge), puedes reemplazar las fuentes numéricas en estos archivos .ttf con tus fuentes numéricas preferidas para cambiar el glifo usado para los números globalmente. Si estás rooteado, deberías poder reemplazar estos archivos de fuentes con tu propia versión modificada.
Tenga en cuenta que nunca he probado esto, tenga en cuenta también que el diseño de algunas aplicaciones puede depender de que las fuentes del sistema sean de un tamaño o forma particular, y estas modificaciones pueden romper el diseño en esas aplicaciones.