Usando LauncherPro se pierde la notificación de conexión usb

Si te refieres a esa cosa en el barra de notificaciones que al tocarlo te permite elegir el modo que desees -- que sigue ahí con Launcher Pro ya que no tiene nada que ver con Sense y Launcher Pro no tiene nada que ver con tu área de notificaciones (a menos, por supuesto, que decidas desactivarla).