La desfragmentación de un equipo Windows normal con un disco duro de "disco giratorio" normal rara vez produce una mejora notable de la velocidad, desde luego nada que ver con lo que anuncian muchas de las empresas de terceros, e incluso en casos extremos en los que la gente crea y elimina regularmente archivos extremadamente grandes (aunque de tamaño irregular), rara vez se notará ninguna mejora si se ejecuta más a menudo que cada 6 meses más o menos. En la mayoría de los casos se trata más bien de un beneficio placebo psicológico. SuperUser:¿Ayuda realmente la desfragmentación?
Los teléfonos no tienen discos duros giratorios, sino una variedad de memorias flash, que tienen velocidades de lectura aleatoria mucho más rápidas que un disco que tiene que girar hasta que la pieza correcta de datos está bajo el cabezal de lectura. Además, los circuitos controladores de la memoria flash organizan los datos a medida que se escriben, lo que permite "escribir a nivel" en todo el disco flash y evitar las partes problemáticas de la memoria. Consulta estas preguntas de SuperUser sobre este tema para obtener más información ¿Es necesario desfragmentar un SSD? , ¿Es malo desfragmentar una memoria USB?
Además, desde Honeycomb (Android 3.x) en adelante, el sistema operativo Android por defecto no da un PC conectado acceso completo al sistema de archivos interno, en lugar de montar como una unidad USB que utiliza MTP para controlar cómo el PC puede acceder a la memoria, y sólo la tarjeta SD se le permite ser montado como una unidad USB normal. Hasta donde yo sé, no hay forma de que un PC tenga suficiente acceso al sistema de archivos para hacer una desfragmentación a través de MTP.
Tl;dr la forma en que funciona la memoria flash significa que una desfragmentación en realidad no hace casi nada, y puede tener un ligero efecto secundario de reducir ligeramente la vida útil de almacenamiento de su teléfono.