Mientras escribía esta pregunta este fue uno de los enlaces que me proporcionó el sitio:
¿Cómo puedo desactivar el sonido de "clic" en la aplicación de la cámara?
Resulta que se puede utilizar un método similar para desactivar el sonido del "tic" del sistema en cuestión, así como el sonido del obturador de la cámara.
He borrado (movido) este archivo:
/system/media/audio/ui/TW_Touch.ogg
y luego reinicié mi dispositivo, ¡ahora soy libre de navegar por mi teléfono en paz y tranquilidad! y no perderé txt's o llamadas debido a que mi dispositivo está en silencio.
EDITAR: Al buscar mejor en la configuración encontré que esta opción está realmente presente en Settings->Sound->Audible selection
Desactivarlo ahí es la solución preferida ya que no requiere Root. (no sé cómo me las arreglé para no ver esto las 2 veces que he mirado)