¿Cuál es la diferencia entre AOSP/vanilla y stock?

Ambos son Linux, pero el kernel AOSP es un kernel de Linux muy estandarizado y general proporcionado por Google que requiere una modificación mínima para funcionar en diferentes dispositivos, facilitando a los fabricantes que Android funcione.

Las diversas modificaciones realizadas por los fabricantes a sus propios kernels se relacionan con el hardware diferente que se encuentra en estos dispositivos. Por lo tanto, HTC puede habilitar algunas funciones en su kernel original que solo funcionan en ese dispositivo HTC en particular y no funcionarían en otros dispositivos de otros fabricantes.

Un ejemplo de esta función es la grabación de voz que estaba presente en una cierta versión del kernel original de HTC Hero, pero esta función no sería posible en el kernel AOSP porque los controladores utilizados para la grabación de voz solo eran compatibles con el kernel de HTC, no con la versión AOSP.

De manera similar, una ROM AOSP es una construida directamente a partir de las fuentes no modificadas de Google, mientras que una ROM original es la versión modificada por el fabricante de Android que viene con un dispositivo o se lanza como una actualización oficial.

El software AOSP es lanzado por el Proyecto de Código Abierto de Android (es decir, por Google), mientras que el software de stock puede incluir modificaciones hechas por los fabricantes.