Cuestión básica.
Es probable (y se espera) que una actualización del firmware (o del sistema operativo) borre cualquier dato o configuración del usuario.
Estos ajustes no son fáciles de traducir / ajustar a través de tal actualización. Sin embargo, la mayoría de las herramientas le avisarán antes de proceder.
En más detalle
Actualización del firmware (código ROM)
Una actualización del firmware normalmente causar TODOS los datos de usuario, ajustes y aplicaciones (cargadas a medida) que se pierda . Esto se debe a que muchas aplicaciones y su identidad en línea (conexión con la tienda electrónica) suelen ser específicas del firmware.
Excepciones: Para una actualización menor puede ser posible sólo reemplazar el firmware, y no interrumpir las capas superiores. Esto es sólo consejos para desarrolladores y los verdaderamente aventureros.
Su caso específico: Está intentando reemplazar el firmware de Telstra (gran empresa de telecomunicaciones australiana) con (posiblemente) un firmware posterior. Esto probablemente no incluyen cualquier aplicación específica de Telstra, y necesitarías volver a registrar el teléfono (al completarlo). Para entonces TODOS los datos, configuraciones y aplicaciones se habrían perdido.
Actualización del firmware (Android OS)
Una actualización de Android normalmente intentan retener TODOS los datos de usuario, ajustes y aplicaciones (cargadas a medida). Pero esto sólo es cierto para las actualizaciones menores, ya que los cambios mayores harán que las aplicaciones existentes sean incompatibles. Para cada aplicación el proveedor puede proporcionar una actualización con soporte para la nueva versión para convertir (o importar) cualquier dato antiguo.
Excepciones: Si está intentando una actualización importante de Android (por ejemplo, de 3.2 a 4.0+) esto muy probablemente no conservar (en cualquier forma útil) cualquiera de sus configuraciones.
Su caso específico: Si estaba usando KIES para actualizar Android de 4.0 a 4.0.4 (o similar) esto debería ser tan indoloro como las actualizaciones de OTA (over-the-air) (que se indican en su teléfono). Sin embargo, en su descripción no queda claro qué tipo de "firmware" (Android o ROM) está sugiriendo.
Nota: No he usado KIES, ya que no tiene soporte para Linux.
Recomendación:
Mira las herramientas de sincronización o de copia de seguridad, para guardar cualquier dato del usuario (números de teléfono, mensajes, etc.) en tu PC. Cualquier aplicación será más problemática, pero seguirá disponible (en la tienda online) para volver a descargarla.