Un poco más de juego me llevó a una (si no LA) solución. Encontré una casilla de verificación "habilitar botones de auriculares" en Meridian, lo que me llevó a investigar más a fondo en BeyondPod, donde encontré una configuración similar.
Ahora todo funciona como me gustaría.
Sin embargo, he vuelto a comprobar un par de cosas que no son exactamente como esperaba. Pensaba que si volvías a activar los controles de una aplicación, se desactivarían los de la otra. Esto no es exactamente lo que ha pasado. Cuando volví a activar Meridian, respondió a los controles, aunque BeyondPod seguía mostrando que supuestamente respondía, cosa que no hizo. Una vez que desactivé Meridian de nuevo, tuve que volver a BeyondPod, desactivar y volver a activar su control para que respondiera de nuevo.
Mi principal queja era que si estaba escuchando un podcast y pulsaba los controles de los auriculares, la música empezaba a sonar por encima del audio del podcast. Aunque puede ser una bonita demostración multitarea, no es un uso especialmente práctico de esta función, IMH(BC)O.
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Problema similar pero con diferentes aplicaciones de música Android.stackexchange.com/questions/5994/ ¿hay opciones similares en Meridian?
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Así que tuve esta página abierta en otra pestaña durante años antes de ver que no había guardado el comentario. Probablemente habría sido más útil que encontraras la respuesta tú mismo.