La única razón que conozco para que un sistema operativo utilice mucha conexión de datos es la descarga de actualizaciones. ¿Tu teléfono ha instalado muchas actualizaciones del sistema recientemente? ¿Estás usando el firmware de fábrica o has instalado un sistema operativo personalizado como CynogenMod posiblemente incluso un construcción nocturna que se actualiza cada noche?
Para el uso de datos de Chrome puede haber un montón de razones - por lo general depende completamente de lo que haces con tu navegador. Si descargas archivos grandes, por ejemplo, eso también se contabilizará como uso de datos de Chrome. También ver vídeos o películas completas a través del navegador se contabilizará como uso de Chrome.
Tal vez quieras probar 3g watchdog que es una muy buena aplicación para la supervisión del tráfico que utilizo desde hace 2 años - tal vez eso dividiría mejor los componentes individuales del sistema que utilizan datos wifi.