¿Las nuevas aplicaciones o datos que se instalen o añadan al teléfono Android después de la encriptación también serán encriptados?

Android 6 utilizado Proyecto de código abierto de Android: Cifrado de disco completo

El cifrado de disco completo utiliza una única clave -protegida con la contraseña del dispositivo del usuario- para proteger toda la partición de datos de usuario de un dispositivo. Al arrancar, el usuario debe proporcionar sus credenciales antes de poder acceder a cualquier parte del disco.

Así que todas las aplicaciones y los datos instalados en la partición del disco userdata estarían protegidos por esa clave. Una forma de pensar en Full Disk Encryption es como la llave exterior de una casa, una vez que se puede entrar en ella, el contenido es accesible.