Mover aplicaciones manualmente al sistema

Eso podría ser algo específico. Nunca he encontrado problemas de este tipo (parece ser un kernel panic, o protección del sistema operativo). Intenta ingresar a TWRP, monta /system como RW y luego copia el archivo de la misma manera, en /system/app. En caso de caer en un bucle de arranque, después de reiniciar, simplemente elimina el archivo a través de TWRP.

¿Podrías tener Root sin sistema?

Tengo root systemless

Mi error. Tener un rooting sin sistema significa que la partición principal de tu sistema no está modificada y no puede contener ninguna apk añadida por el usuario. En este caso, necesitarías usar un módulo de Magisk para añadir la aplicación a la partición del sistema al reiniciar.

@MikeN. /system se puede modificar con root sin sistema si dm-verity está desactivado. Pero las actualizaciones pueden romperlo.

Si él fue sin sistema, muy probablemente fue debido a mantener el sistema intacto. Estaba usando el flash zip de Magisk para poder tener Action Launcher como aplicación del sistema, antes de que apareciera el Módulo de Google Now.

@MikeN. el root sin sistema ya no es una opción, ya sea mantener /system intacto o no, boot.img debe ser modificado porque los daemons root deben iniciarse desde init para solucionar problemas con selinux, logs, etc.