¿Hay algún beneficio en borrar la caché de Dalvik después de hacer root a mi teléfono?

Como mencionaste que estás usando Magisk para rootear, asumo que estás utilizando Android 5 o superior.

La respuesta sería no. Puedes ignorar de forma segura "Limpiar la caché de Dalvik" después de actualizar OTA y volver a rootear.

La caché de Dalvik es código binario compilado (DEX optimizado) para tus aplicaciones instaladas, por lo que generalmente tiene sentido limpiarlas si has eliminado/reemplazado tus aplicaciones en modo de recuperación, o modificado el tiempo de ejecución ART (como al instalar Xposed Framework). Los archivos odex para aplicaciones del sistema generalmente vienen con la imagen del sistema y no residen en el directorio dalvik-cache del usuario. Por lo tanto, no es necesario limpiar la caché si has rootado tu teléfono o has flasheado una nueva recuperación, pero se recomienda si ha cambiado algo relacionado con el tiempo de ejecución de la aplicación (por ejemplo, Xposed).