Tengo un EVO y tuve este problema tan pronto como empecé a mover muchas aplicaciones a mi tarjeta SD. Básicamente, las aplicaciones movidas a una tarjeta SD se almacenan en un área segura y aparentemente Android tarda un tiempo en hacer que esta área "segura" esté disponible al arrancar, y esto puede que no suceda antes de que se inicie tu lanzador. Cuantas más aplicaciones tengas, más tiempo tardará en hacer lo que sea que esté haciendo, y en algún momento descubrirás que ninguna de las aplicaciones de la SD está disponible al arrancar.
Reiniciar tu lanzador puede ser necesario o no; el que uso, Tag Home, parece darse cuenta a veces de que las aplicaciones están disponibles en la SD... a veces. Descubrí que un reinicio en caliente (una reinicialización parcial que solo vuelve a cargar la interfaz de usuario del teléfono; puedes encontrar aplicaciones que lo hagan en el Market, aunque necesitas haber rooteado el teléfono) solía ayudar, pero tenía que cronometrarlo adecuadamente, o hacerlo varias veces.
Leí en algún lugar que Gingerbread (Android 2.3) mejora esto. El EVO salió con la versión 2.2 y recientemente apareció una actualización OTA a la 2.3 para él. Todavía no la he instalado por un par de razones: primero, como dije, rooteé mi teléfono y debo ser cauteloso con esto, y segundo, hubo algunos errores reportados en la actualización que serán solucionados más adelante este mes. Así que todavía no sé de primera mano si esto es cierto.
He tenido mucho mejor suerte particionando mi tarjeta SD (añadiendo una partición dedicada de 1GB para aplicaciones) y usando una aplicación del mercado llamada Link2SD. No solo las aplicaciones parecen estar disponibles generalmente en el momento en que se carga el lanzador, sino que puedes mover la aplicación ENTERA a la tarjeta (¿alguna vez notaste que las aplicaciones ocupan algo de memoria interna incluso después de moverlas a la SD?) e incluso mover aplicaciones que no se pueden mover de la forma habitual. (¿HBO GO quiere 15 MB de mi memoria interna? ¡Ya no! Incluso moví Adobe Flash a la SD y sigue funcionando bien.) Sin embargo, tienes que rootear tu teléfono para hacer todo esto y es bastante avanzado.
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Intenta reiniciar tu dispositivo. A veces Android parece confundirse cuando las aplicaciones se mueven de o a la tarjeta SD.
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@usuario4188. Gracias, pero ya lo intenté y no funcionó :(