¿Rootear mi teléfono impediría que pueda utilizar las funciones de protección del dispositivo?

Eso es bastante triste. Solo uno u otro. Pero después de desrootear todo debería funcionar perfectamente, supongo.

Ten en cuenta que esta seguridad que pierdes protege tu dispositivo solo de ataques realizados cuando alguien tiene acceso físico al dispositivo (pero si conectas el dispositivo a una PC con ADB y el atacante obtiene acceso remoto a la PC, el teléfono estará en problemas, pero eso es un gran "si"). Por lo tanto, pierdes esta "protección". En pocas palabras, no dejes el teléfono en manos de personas no confiables y estarás en buena posición. También considera lo que dijo acejavelin. Ten en cuenta que esto se puede evadir (pista: magisk).

@ Creo que el punto clave aquí es que la Protección de Restablecimiento de Fábrica ya no funciona.

Todo lo que realmente quería hacer era eliminar un poco de software innecesario y convertir algunas aplicaciones en aplicaciones del sistema

@AlainGiresse Modificar dispositivos Android modernos ya no es tan simple como solía ser, hay implicaciones significativas al desbloquear el gestor de arranque y hacer root hoy en día. Incluso causando que algunas aplicaciones dejen de funcionar debido al fallo de la API SafetyNet que requiere un teléfono completamente original y reportará un fallo a las aplicaciones incluso si está completamente original y solo desbloqueó el gestor de arranque sin modificar nada en absoluto, aplicaciones como Netflix, Pokemon Go, Android Pay y la mayoría de las aplicaciones financieras dejarán de funcionar cuando falla la comprobación de SafetyNet.