Parallel Space es solo un contenedor, que es un entorno virtual de Android dentro del dispositivo móvil. El contenedor tiene su propia pantalla de inicio, lanzador, aplicaciones y widgets. Las aplicaciones y datos dentro del contenedor están aislados de las aplicaciones fuera del contenedor.
Un contenedor no "clona" aplicaciones, solo separa virtualmente un dispositivo en dos "espacios". No uso Parallel Space, pero uso MyKnox que es un contenedor de Samsung. Y cuando una aplicación se actualiza, también se actualiza en el contenedor y viceversa. No es necesario actualizar por separado.
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Ambas versiones necesitan ser actualizadas por separado. Ver la reseña de la aplicación de Christo Goodman
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Uso la función de aplicaciones duales de Xiaomi (integrada en la MIUI) y actualiza la aplicación dual si la aplicación principal se actualiza.