Si cambias la configuración de la actualización automática en la aplicación Playstore, sólo afectará a las aplicaciones que instales. a partir de entonces (es el valor predeterminado para establecer en la instalación de nuevas aplicaciones). Si no quieres que tus aplicaciones ya instaladas se actualicen automáticamente, tienes que comprobarlo con cada una de ellas:
- Abre la aplicación Playstore
- Vaya a "Mis aplicaciones" (a través del menú "Hamburguesa").
- Abre la configuración de cada aplicación que no quieras actualizar automáticamente y desmarca la opción de actualización automática.
Casilla de verificación de actualización automática (haga clic en las imágenes para ampliarlas)
Véase también este howto para ver un tutorial completo con capturas de pantalla (la segunda captura de pantalla procede de allí). La ubicación y los "visuales" de esa casilla de verificación pueden depender de la versión de la aplicación Play Store, pero el principio debería ser el mismo.
Ten en cuenta que para algunas "aplicaciones del sistema" (normalmente partes de las "Google Apps") es posible que no puedas desactivar esta opción. Me ha ocurrido, por ejemplo, con Servicios de Google Play en algunos dispositivos.