¿Puede el rooting eliminar todo el malware, los virus y las puertas traseras?

Incluso después de instalar ROMs personalizadas, alguna zona del almacenamiento interno no se modifica y si el malware reside en esa zona del almacenamiento interno no se eliminará incluso después de flashear una nueva ROM pero es un caso muy raro cuando un malware se adentra tanto en el sistema.
Si quieres otro ejemplo de esto, intenta instalar un logo de arranque (sé que no es un malware) pero incluso después de flashear 100s de ROMs nunca cambiará el logo de arranque de tu dispositivo y esto demuestra que algún código permanece sin cambios incluso después de flashear nuevas ROMs

El rooting le permite modificar el sistema y acceder a todos los datos de la aplicación. No cambia nada con respecto al malware o virus ya instalado.

Si has rooteado el dispositivo usando un exploit, el malware instalado también puede usar este exploit para obtener acceso Root.

Conclusión: Si su dispositivo está infectado, elimínelo y reinstale un sistema/imagen no contaminado. Sin embargo, el malware avanzado puede incluso sobrevivir a una instalación de una nueva ROM potencialmente en las particiones que no se borran o en las roms flash de los chips integrados.

Por lo tanto, la única forma 100% segura de deshacerse del malware es destruir físicamente el dispositivo. Sin dispositivo, no hay malware.

El rooteo no tiene nada que ver con la eliminación de malware. El rooting es un proceso en el que se obtiene un superusuario en el teléfono para tener un control total sobre el dispositivo (como el acceso a todos los archivos y carpetas, etc.) Lo que se puede hacer es eliminar las aplicaciones del sistema. Y esos teléfonos chinos tenían malware probablemente a nivel del kernel o incorporado en el sistema, no como aplicación.