Necesitarías un plugin que te permita interactuar con Chrome (ya que Chrome no viene con una forma integrada de que otras aplicaciones vean la dirección web actual), no pude encontrar uno con una búsqueda rápida, pero puede que haya uno.
Puedes configurarlo para que cuando abras un enlace específico en Chrome (ya sea desde la aplicación de búsqueda de Google, Facebook u otra aplicación), escanee el intento* en busca de ciertas URL y, si las contiene, te alerte; si no las contiene, pase el intento a Chrome.
Esto puede hacerte caer en un ciclo (intenta pasar el intento, pero lo vuelve a capturar), por lo que podrías usar un servicio de redirección (es decir, pasas el intento con algo extra al frente para que no lo vuelva a detectar, y luego Chrome lo carga, se redirige a la dirección web original).
Un último pensamiento, podrías usar Tasker para registrarte para recibir enlaces específicos (el mismo método que permite abrir enlaces en aplicaciones cuando haces clic en ellos, por ejemplo, Wikipedia).
De todos modos, el siguiente enlace debería ser útil, supongo que te gustaría resolverlo por tu cuenta, así que no proporcionaré una solución paso a paso (a menos que realmente la desees): http://tasker.dinglisch.net/userguide/es/intents.html
*un intento es un mensaje que se envía entre aplicaciones en Android, por ejemplo, cuando haces clic en un enlace y se abre en tu navegador web, o haces clic en una dirección y se abre en mapas.