Además de la posibilidad que planteó bmdixon de que se trate de malware, me gustaría añadir que es totalmente posible que ni siquiera sea necesariamente malware, sino más bien adware de tipo ingeniería social que intenta que instales malware o compres algo inútil. A menudo se ven ese tipo de mensajes emergentes en sitios web para usuarios de Windows, y esto me suena muy parecido. Sin más información, como la aplicación que ha aparecido este mensaje o una captura de pantalla, esta sería mi suposición en cuanto a lo que está sucediendo en su teléfono.
Muchos de estos tipos de adware pueden bloquearse mediante bloqueadores de anuncios a nivel de sistema, como AdAway que puede instalarse desde repositorios como F-Droid si tienes Root. (tales bloqueadores ya no están disponibles en Google Play, ya que socavan el modelo de negocio principal de Google) O, por supuesto, no instalando aplicaciones que dependen de los ingresos por publicidad para empezar :)
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Eso suena muy sospechoso y poco fiable. ¿Puede publicar una captura de pantalla y el enlace que quiere que haga clic?
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¿Has instalado aplicaciones desde otros lugares que no sean la Google Play Store? Si no es así, yo diría que es bastante improbable (aunque no imposible) que realmente tengas malware. A excepción de esta aplicación sospechosa, que probablemente esté intentando engañarte para que hagas clic en un anuncio y/o descargues alguna otra basura. Como dice ce4, una captura de pantalla sería muy útil en este caso.
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Bueno, ese mensaje podría ser cierto. Yo eliminaría la aplicación que lo envió, estaba informando (o mejor dicho, saliendo) de que era un malware. No haga clic en ese enlace o realmente estarás en problemas.
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¿Qué tipo de mensaje? Hay diferentes tipos Y la forma de averiguar qué aplicación es la responsable es diferente en cada caso.