En general, cuanto más lenta sea tu velocidad de reloj, menor será el consumo de energía de tu dispositivo. Pero si bajas tu velocidad de reloj... entonces las cosas funcionarán con lentitud, especialmente si bajas del rango de los 500mhz.
SetCPU tiene diferentes "perfiles" que controlan el comportamiento de tu CPU. Puedes hacer que funcione al máximo rendimiento (para obtener los mejores tiempos de respuesta y el peor uso de la batería), pero normalmente utilizas el que viene por defecto, en el que sólo "acelera" el procesador cuando realmente se utiliza y se necesita.
Podrías, por ejemplo, hacer que SetCPU bajara la velocidad de tu reloj a algo mucho más bajo de lo normal cuando la pantalla está apagada.
Los granos también son importantes. Algunas personas han creado núcleos de "bajo voltaje" que pueden ayudar a la duración de la batería. Pero el uso de kernels distintos al de serie puede variar, ya que normalmente se salen de los límites de las especificaciones de la CPU (por lo que un kernel de "bajo voltaje" puede funcionar bien en un dispositivo pero no en otro).
Los fabricantes de dispositivos quieren que tengas una buena experiencia con tu dispositivo con la configuración de fábrica. Al cambiar la velocidad del reloj (a una velocidad más baja), debes esperar una degradación del rendimiento a costa de una mejor duración de la batería.