No es necesario crear tus propias carpetas.
El archivo adecuado para poner los mp3s es /system/media/audio/ - donde encontrarás carpetas para /alarmas, /notificaciones y /tonos de llamada.
Hay dos cosas que tener en cuenta al hacer esto:
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Si estás usando .mp3 de tamaño completo, ejercerás una considerable presión sobre el sistema cuando llegue el momento de cargar uno. En mi experiencia, dos minutos de mp3 funcionan bien para una alarma, pero ese archivo tarda unos segundos en cargarse y no será adecuado como tono de llamada a menos que recortes el archivo primero.
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Tendrás que volver a hacer esto cada vez que instales una nueva ROM.
Una alternativa a esto es tenerlos en /sdcard/media/ - Pero si tienes un dispositivo más antiguo, tenerlos en el directorio root permite un mejor rendimiento.
¡Espero que esto ayude!