No estoy 100% seguro, pero según recuerdo, el problema con el almacenamiento USB normal es que Android tiene que particionar tu teléfono para el almacenamiento interno y el almacenamiento USB. Tu computadora puede desmontar el almacenamiento USB del teléfono y montarlo en la computadora. Por lo tanto, en muchos teléfonos sin MTP, aunque el almacenamiento interno tiene una capacidad de 16GB, solo 1 o 2 GB estaban disponibles para la instalación de aplicaciones. Mientras que algunos teléfonos daban hasta 8GB para aplicaciones, ese espacio se desperdiciaba para personas que no necesitaban tanto espacio para aplicaciones pero necesitaban espacio para música y fotos.
Con el modo MTP, no hay partición separada sino una sola partición completa. Entonces, si tienes 16GB de almacenamiento interno en tu teléfono, puedes usar los 16GB completos para aplicaciones, música y fotos.
El modo MTP está disponible desde Honeycomb y no creo que sea un componente opcional. Es decir, no creo que puedas elegir decir "No quiero el modo MTP, quiero el modo de almacenamiento USB".
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