Si tu dispositivo funciona al menos con Android 4.0 (o superior), puedes decirle al sistema que prohíba a una aplicación el uso de "datos de fondo" (es decir, subir/descargar cosas que no hayas activado manualmente de forma explícita). Para ello, ve a Ajustes → Uso de datos y verás una pantalla como la primera de abajo:
Uso de datos / Restringir los datos de fondo (haga clic en las imágenes para ampliarlas)
Estoy bastante seguro de que ya has puesto "Datos móviles" en su posición de "encendido". Ahora marca la casilla "Establecer el límite de datos móviles". A continuación debes definir tus límites; si no quieres ningún "límite global", puedes usar "valores falsos" aquí, por ejemplo, estableciendo la barra roja en 10 GB, y la barra naranja en 8 GB.
Una vez hecho esto, desplácese por la lista de aplicaciones en la parte inferior para encontrar la aplicación que desea restringir - en su caso, el Kindle app. Toca esa entrada para abrirla y vuelve a desplazarte hasta el final de la pantalla. Allí encontrarás otra casilla de verificación etiquetada "restringir datos de fondo" (ver segunda captura de pantalla) - márcala, y ya está: la Kindle La aplicación no debería seguir utilizando datos móviles sin que usted se lo diga activamente.